1645年，朱聿键在郑芝龙的拥护下，登基做了皇帝，到1649年隆武五年初，他终于摆脱了傀儡的命运，便立时开始了他的布局。
在做傀儡皇帝的日子里，隆武皇帝对于明朝如今的局势，已有深刻的认识。
现今明朝最大的问题，除了满清的外部威胁，就是地方势力做大，皇权旁落的问题。
如果不重塑中央权威，加强皇帝威严，帝国便是一盘散沙，即便能够击败满清，也会向汉末割据演变。
虽然依靠现在地方督抚还有武将，隆武或许能够恢复基业，但是隆武觉得这个机会渺茫，而且即便恢复，江山也不能算是他的。
现在隆武虽贵为皇帝，但却无法拿地方督抚怎么样，甚至不敢换掉那些不听话的督抚，这算什么皇帝，算什么天子。
此时，朱聿键有不少忠臣，不过这些忠臣，大多手握重兵，使得朱聿键投鼠忌器，很难控制他们，对他们也不放心，所以他决定重用他的兄弟，让他们来掌握权力。
虽然藩王做大，同样会威胁他的位置，可相比于大权旁落，异性夺权，朱聿键情愿接受今后宗藩做大的苦果。
再者，现在先利用宗藩，来稳固皇权，解决眼下军阀割据的问题，等以后宗藩做大，他照样可以削藩。
房间内，朱聿键与唐、豫两王畅谈，让他们明白朱家江山面临的危机，与两人相谈一夜。
次日，朱聿键便留下唐王朱聿鐭坐镇赣南，又让豫王朱聿锷南下广州。
如此一来，朱聿键移驾长沙后，亲自掌控湖广，又有两个兄弟，分别控制江西和广东，他才能逐渐成为帝国真正的主宰，重新掌握生杀大权，成为乾坤独断，说一不二的帝王。
那时朱以海虽得浙系拥护，但是也比不上他。
浙系由一帮军阀组成，朱以海拿手军阀其实没有办法，不过朱以海和浙系众将之间的关系，并不是谁压服谁，而是一种有默契的合作，朱以海不会对他们提无礼过分的要求，浙系众将也不将其视为傀儡，希望靠拥戴朱以海登基，来获得政治上的利益。
这是由两人此时的位置决定，朱以海只是国储，需要团结众人，给他们利益，来获得他们的支持，从而登上大位，而朱聿键已经是皇帝，他考虑则是如何恢复皇帝的尊严，加强他的皇权，不使得大权旁落。
在赣州几日后，朱聿键遂即起驾进入湖广，于二月底，进驻长沙，受到长沙百姓的热烈欢迎。
朱聿键遂即下旨，改长沙为西京，为朝廷临时行在，并下旨不建宫殿，以示决心光复之意，并决议，从楚赣将士中，拣选精锐，重组京营兵，另外派出十三员御史，巡查地方，严惩贪污，重建朝廷威信。
朱聿键移驻长沙后，在袁州与清军的对持的李过高一功，自江西撤回湖广，西线战事彻底平息。
于此同时，满将浙江总督张存仁，撤出严州，浙东马光辉也放弃对四明山的围剿，撤回宁波城，东线也进入休战的状态。
至此，因为郑芝龙降清，引发的一场波及浙、闽、赣、楚四省的战事，终于停歇，明清双方又退回到了开战前的疆域。
虽说双方疆域没有什么变化，不过这场仗下来，却是令满清伤了筋骨，短时间没有能力再发起新的战争。
整场战役下来，清军入闽主力被击溃，死伤惨重，再加上清军在浙江、赣南战场的损失，兵马伤亡共计七万余人，要命的其中还有两万人是八旗兵。
满清的精锐就是八旗，靠着八旗兵不能战胜的神话，满清才能震慑天下，驱使数倍于八旗的汉兵，为满清效命。
此前金华之战，就已经让八旗丢了颜面，现在又折损两万，这已经不是兵马损失的问题，而是会让天下质疑八旗的能力，满万不可敌，是不是假的。
人员损失，满旗可以从关外抓野人补充，蒙旗可以从外藩中挑选，汉旗可以通过给绿营抬旗来补充，并不是不能解决。
可是满清十多年征战树立起来，八旗不可敌的神话崩塌，那问题就大了。
多尔衮心中也清楚，都是人，一旦汉人不惧怕八旗，那满人在关内的统治，根本无法维持。
因此这一战，不紧是使得清军元气大伤，而且还对清军士气造成了极大的伤害，没有一场大胜的话，恐怕旗兵都要自我怀疑了。
这一战，对于明朝而言，明军损失同样不小，不过原本一直没有为抗清出力的十余万郑军崩溃，被浙系收编，以及被抗清的郑氏将领掌控，明军实力其实不仅没有削弱，反而有所加强。
在加上连续的胜利，使得明军克服了对清军的恐惧心里，士气大增，终于使得明军有勇气直面清军，并一决高下。
这样一增一减之下，原本占据绝对优势的清军，优势局面逐渐被抵消，虽依旧是清强明弱，但是满清要灭明朝已经不易了。
如果说以前清军有实力一战灭明，那么现在明朝便勉强能够与清军搏杀几个回合，清军打得好，才有机会灭明，打不好，自身反而都有危险。