卫统领南衙府兵，天下各道设立军府，编额五十七万六千，每卫编有四万八千。
此外南衙还有四府，四府为金吾卫府、千牛卫府、备身卫府、监门卫府。此四府不统外府兵，只统皇帝近身侍卫以及宫门守卫。
另外还有内军十二军府，内军则是亲勋翊三卫六军府，以及东宫亲勋翊三卫六军府，内军皆由贵族勋戚官员子弟充当。
整个大秦军队体系很清晰明确，规模也十分庞大，达到百万之众。
其中南衙府兵是属于战时为兵闲时为农的农兵一体，而禁军体系，则是募兵制下的常备军职业兵体系。
主要是从府兵中精选的年轻精锐之兵，他们当兵拿饷，职业军人。
至于南衙四府，则是府兵番上宿卫。
而内军，则是勋戚官员子弟充当，这些人充当皇帝的侍卫同时，也相当于是武官培训。
没有全面继承隋朝的府兵制，是因为大秦的国策是要不断开疆拓土的，因此必须有常备军，而不搞全面募兵制，则是因为全面募兵制军费太高，大秦也吃不消。
所以北衙禁军和南衙府兵，其实就相当于是两级军制，一般情况下，有北衙军就够了，若是战事规模扩大，或者内部叛乱的情况下，则开始征召府兵补充。
北衙军由皇帝直接统领，而南衙军由宰相负责。枢密院、兵部、十二卫、十二军分别掌握军令、军政、统兵等职权。
一般情况下，大秦朝廷只需要供养北衙的十二军以及南衙四府和内军即可，军费开支降低同时，秦军的战斗力又能保持。
而将来分封诸侯后，各诸侯国内的驻军，也一样还是在南衙十二卫府里抽调兵马，在其兵额之内。
南衙十二卫主将称大将军，北衙十二军主将则称上将军，品级皆为正三品。
四府和内军二十军府主将，则称为中郎将，品级正四品。
军改内容巨大，随之而来的也将是全军范围内的一次巨大将领对调。
十二位南衙大将军，十二位北衙上将军，四位南衙中郎将，十二位内军中郎将，再加上二十位左都督指挥使和二十位右都督指挥使，这么多职位，谁能上，谁不能上，足够让皇帝和宰相们头痛许久了。
好在有辅公祏的前车之鉴后，皇帝和宰相们相信，军改应当会比较顺利，不会再有人脑子发昏乱来了。